چينش کاتهاي پلان ساژيتال را بروي پلان اگزيال تنظيم ميکنيم : کاتها را موازي ميدلاين (خط وسط مغز) زاويه ميدهيم.و در پلان کرونال کاتها را موازي خطي که از ميان بطن سوم و ساقه مغز ميگذرد تنظيم مي کنيم
اسلايسهابايستي تمام مغز را از لوب تمپورال تا لوب تمپورال ر پوشش دهد